Selçuklu ve Osmanlı döneminde Hıristiyanlığı benimsemiş olarak dil, örf ve adetlerinde değişiklik olmaksızın varlıklarını sürdüren bu insanlar, Kurtuluş Savaşı yıllarında da Yunan Ordusuna karşı Türk Ordusunun yanında yer almışlardır. Ankara`da yeni kurulan Hükümete çektikleri telgraflarla, işgal ordularını destekleyen ve Türk Devletinin bölünmesini ve yıkılmasını hedefleyen Fener Rum Ortodoks Patrikhanesi ile ilişkilerini kestiklerini deklare etmişlerdir. Milli Devlet`i ve Orduyu desteklemek amacıyla teşkilatlanmışlar ve Kayseri`de yeni bir Patrikhane kurmuşlardır. Ancak, savaş sonrasında Lozan Antlaşması ile kararlaştırılan mübadele cemaatlerini kaybetmelerine sebebiyet vermiştir. Anadolu`daki cemaatlerini kaybetmesine rağmen bu Patrikhane, İstanbul`a taşınarak Fener Rum Ortodoks Patrikhanesi ile olan mücadelesini aksatmaksızın devam ettirmiş, varlığını günümüze kadar sürdürmüştür.