Bizans`ı günümüze kadar uzanan ekümeniklik iddiası ve Rum Ortodoks Kilisesi`ne dahil etmek için yapmış olduğu baskı ve zulümler nedeniyle İstanbul`da yerleşik Ermeniler için yüksek bir ruhani merkez oluşmamıştır. Fatih Sultan Mehmet`in İstanbul`u fethiyle İslam medeniyetine dahil olan Ermeni Başpiskoposluğu, Kudüs Patrikliği`nde olduğu gibi İslam`ın müsamahası ve zımmileri idari sistemi gereğiyle sivil yetkileri de içeren bir patriklik haline gelmiştir.